Cell line name | M059K | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_0401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: M059K (RRID:CVCL_0401) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Characteristics: Radioresistant (PubMed=7494872). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Brain; UBERON=UBERON_0000955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Glioblastoma (NCIt: C3058) Glioblastoma (ORDO: Orphanet_360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_0400 ! M059J | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 33Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8316628; DOI=10.2307/3578196 PubMed=7494872; DOI=10.2307/3578948 PubMed=10629611; DOI=10.1667/0033-7587(2000)153[0125:COTRMC]2.0.CO;2 PubMed=11023613; DOI=10.1667/0033-7587(2000)154[0473:HTFTMG]2.0.CO;2 PubMed=12105990; DOI=10.1667/0033-7587(2002)158[0195:DOAGMI]2.0.CO;2 PubMed=18077418; DOI=10.1073/pnas.0707579104 PubMed=21406405; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-3112 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2365
BCRC; 60381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007446
MCCL; MCC:0000295 cancercelllines; CVCL_0401 Cell_Model_Passport; SIDM00639 DepMap; ACH-000152 LINCS_LDP; LCL-1362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473046
BioSample; SAMN10987790 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; M059K_878_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54903416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887286 GEO; GSM888361 GEO; GSM1374641 GEO; GSM1670071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 897445
Cosmic; 1237543 IARC_TP53; 28272 LiGeA; CCLE_918 Progenetix; CVCL_0401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 30-Jan-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |