Cell line name | PFSK-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | PFSk-1; PFSK1; PFSK | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: PFSK-1 (RRID:CVCL_1642) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Caucasian. Doubling time: ~30 hours (ATCC=CRL-2060). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Brain, right frontal lobe; UBERON=UBERON_0002810. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primitive neuroectodermal tumor (NCIt: C3716) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 1Y10M | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; DepMap Markers:
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Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/PFSK-1_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1316433; DOI=10.1097/00005072-199205000-00005 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50005-8 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2060
IZSLER; BS TCL 202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008425
cancercelllines; CVCL_1642 Cell_Model_Passport; SIDM01132 Cosmic-CLP; 683667 DepMap; ACH-001711 LINCS_LDP; LCL-1407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471425
ENCODE; ENCBS054ENC | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308802
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075560 GDSC; 683667 PharmacoDB; PFSK1_1264_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54947302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM923430 GEO; GSM1670349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 683667
Cosmic; 923655 Cosmic; 973260 Cosmic; 1728490 Cosmic; 1995615 IARC_TP53; 21279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 05-Oct-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |