Cellosaurus WM793 (CVCL_8787)
Cell line name | WM793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | WM-793; WM 793; WML 793; WM793B; WM-793B; WM 793B; WM793b; WC00062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_8787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_5414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: WM793 (RRID:CVCL_8787) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Wistar Institute melanoma cell line collection. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: The reported STR profile from Wistar of this cell line was changed at one point between February 2016 when we retrieved them and entered them in the Cellosaurus and May 2018. The major changes were: D18S51: 11,14->14,15. Derived from site: In situ; Skin; UBERON=UBERON_0002097. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=15592718
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cutaneous melanoma (NCIt: C3510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 37Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; ESTDAB; Genomics_Center_BCF_Technion; PubMed=27087056; Wistar Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://web.archive.org/web/20141129125241/http://www.wistar.org:80/lab/meenhard-herlyn-dvm-dsc/page/melanoma-cell-lines-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4053039 PubMed=2253310; DOI=10.1007/BF00046337 PubMed=2068080; DOI=10.1073/pnas.88.14.6028 PubMed=8342600 PubMed=8160777 PubMed=11123321; DOI=10.4049/jimmunol.166.1.432 PubMed=15592718; DOI=10.1007/s00262-004-0561-5 PubMed=16827748; DOI=10.1111/j.1600-0749.2006.00322.x PubMed=18632627; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-08-0235 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=23851445; DOI=10.1158/1541-7786.MCR-13-0006 PubMed=24576830; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-13-2625 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27087056; DOI=10.1038/srep24569 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2806 - Discontinued
Coriell; WC00062 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009619
cancercelllines; CVCL_8787 Cell_Model_Passport; SIDM00973 Cosmic-CLP; 1299081 DepMap; ACH-000827 ESTDAB; ESTDAB-083 LINCS_LDP; LCL-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004612 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471791
BioSample; SAMN10987987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4630605
ChEMBL-Targets; CHEMBL4630705 GDSC; 1299081 PharmacoDB; WM793_1664_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_8787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54994312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM109043 GEO; GSM185202 GEO; GSM185203 GEO; GSM185204 GEO; GSM185205 GEO; GSM188235 GEO; GSM188265 GEO; GSM188324 GEO; GSM887738 GEO; GSM888833 GEO; GSM952587 GEO; GSM1670581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 686397
Cosmic; 886836 Cosmic; 928693 Cosmic; 972274 Cosmic; 1155266 Cosmic; 1155545 Cosmic; 1155567 Cosmic; 1238114 Cosmic; 1303078 Cosmic; 2159433 Cosmic; 2163810 IARC_TP53; 24995 LiGeA; CCLE_074 Progenetix; CVCL_8787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD004343
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 30-Jan-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |