Cell line name | HaCaT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HaCAT; HACAT; Hacat | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HaCaT (RRID:CVCL_0038) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Doubling time: 28 hours (PubMed=32938951). Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Metabolome analysis. Omics: Transcriptome analysis. Caution: Although HaCaT is distributed by a number of sources, the only official DKFZ-approved supplier is CLS. Derived from sampling site: Back; skin; epidermis; keratinocyte. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for TP53 p.His179Tyr (c.535C>T) (ClinVar=VCV000127815) (PubMed=8504475).Heterozygous for TP53 p.Arg282Trp (c.843_844CC>TT) (PubMed=8504475). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 62Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Spontaneously immortalized cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID; CLS; DSMZ; PubMed=11416159; PubMed=21868764 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://en.wikipedia.org/wiki/HaCaT http://www.proteinatlas.org/learn/cellines http://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-347.html http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=1562 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=3023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2450098; DOI=10.1083/jcb.106.3.761 PubMed=8162337; DOI=10.1111/j.1600-0625.1993.tb00030.x PubMed=8504475; DOI=10.1093/carcin/14.5.833 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=9406811; DOI=10.1111/1523-1747.ep12340708 PubMed=10523843; DOI=10.1038/sj.onc.1202934 PubMed=11583982; DOI=10.1016/S0002-9440(10)62541-2 PubMed=15389883; DOI=10.1002/jcb.20212 PubMed=20097197; DOI=10.1016/j.yexcr.2010.01.020 PubMed=21269460; DOI=10.1186/1752-0509-5-17 PubMed=21868764; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-11-0690 PubMed=21185708; DOI=10.1016/j.jnutbio.2010.08.004 PubMed=26989177; DOI=10.1242/dev.133728 PubMed=29660373; DOI=10.1016/j.bbagen.2018.04.012 PubMed=31629070; DOI=10.1016/j.tiv.2019.104666 PubMed=32938951; DOI=10.1038/s41598-020-71315-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; T0020001/117
BCRJ; 0341 - Discontinued CCTCC; GDC0106 CLS; 300493/p800_HaCaT DSMZ; ACC-771 - Discontinued ICLC; HL14001 - Discontinued IZSLER; BS CL 168 KCB; KCB 200442YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl7229
CCRID; 3111C0001CCC000373 CCRID; 3142C0001000001712 Lonza; 56 TOKU-E; 3890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0000552
EFO; EFO_0002056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308509
ChEMBL-Targets; CHEMBL614392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSE57080
GEO; GSM913344 GEO; GSM913345 GEO; GSM960278 GEO; GSM960279 GEO; GSM960280 GEO; GSM960286 GEO; GSM960287 GEO; GSM960288 GEO; GSM960294 GEO; GSM960295 GEO; GSM960296 GEO; GSM1375594 GEO; GSM1375595 GEO; GSM1375596 GEO; GSM1375597 GEO; GSM1375598 GEO; GSM1375599 GEO; GSM1375600 GEO; GSM1375601 GEO; GSM1375602 GEO; GSM1375603 GEO; GSM1375604 GEO; GSM1375605 GEO; GSM1861816 GEO; GSM1861817 GEO; GSM1861820 GEO; GSM1861821 GEO; GSM2112559 GEO; GSM2112563 GEO; GSM2495796 GEO; GSM2495797 GEO; GSM2495798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q5636366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1530737
IARC_TP53; 1820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000496
PRIDE; PXD000670 PRIDE; PXD002460 PRIDE; PXD007789 PRIDE; PXD013113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |