Cell line name | U2OS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | U-2 OS; U-2OS; U-2-OS; U2-OS; U20-S; U20S; 2T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_L856 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: U2OS (RRID:CVCL_0042) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~25-30 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Cell surface proteome. Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Metabolome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Omics: Virome analysis using proteomics. Misspelling: U-205; Occasionally. Misspelling: U205; Occasionally. Derived from sampling site: Bone; tibia. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Mutation; TP53; none detected (PubMed=19787792). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Osteosarcoma (NCIt: C9145) Osteosarcoma (ORDO: Orphanet_668) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 15Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CLS; CCRID; Cosmic-CLP; DSMZ; ECACC; KCLB; PubMed=19787792; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.phe-culturecollections.org.uk/media/167509/u2os-celllineprofile.pdf http://141.61.102.20/mxdb/project/show/9191407937500 http://www.proteinatlas.org/learn/cellines http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=U2-OS http://micro.magnet.fsu.edu/primer/techniques/fluorescence/gallery/cells/u2/u2cells.html http://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/u/cell-lines-detail-92.html http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/U2OS_Farnham_protocol.pdf http://tcpaportal.org/mclp/ http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=28 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=656 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=2192 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6081590; DOI=10.1002/ijc.2910020505 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=7017212; DOI=10.1093/jnci/66.6.1003 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2823272; DOI=10.1073/pnas.84.21.7716 PubMed=8275086; DOI=10.1038/ng1193-230 PubMed=8040301; DOI=10.1172/JCI117360 PubMed=8617485; DOI=10.1016/S0046-8177(96)90115-X PubMed=12645653; DOI=10.1016/S0165-4608(02)00685-4 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=15736406 PubMed=17354236; DOI=10.1002/ijc.22643 PubMed=18359981 PubMed=19787792; DOI=10.1002/gcc.20717 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=21519327; DOI=10.1038/labinvest.2011.72 PubMed=22068332; DOI=10.1038/msb.2011.82 PubMed=22278370; DOI=10.1074/mcp.M111.014050 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=24136885; DOI=10.1002/pbc.24801 PubMed=24618588; DOI=10.1371/journal.pone.0091433 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25894527; DOI=10.1371/journal.pone.0121314 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; HTB-96
BCRC; 60187 BCRJ; 0304 CLS; 300364/p489_U-2_OS DSMZ; ACC-785 ECACC; 92022711 ICLC; HTL11001 KCB; KCB 200962YJ KCLB; 30096 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl53
CLDB; cl4579 CLDB; cl4580 CLDB; cl4581 CLDB; cl7217 CCLE; U2OS_BONE CCRID; 3111C0001CCC000028 CCRID; 3131C0001000700088 CCRID; 3142C0001000000955 Cell_Model_Passport; SIDM01191 Cosmic-CLP; 909776 DepMap; ACH-000364 LINCS_LDP; LCL-1431 Lonza; 676 TOKU-E; 3379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0001938
CLO; CLO_0001272 CLO; CLO_0009454 EFO; EFO_0002869 MCCL; MCC:0000468 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSR3V9ST6H
BioSample; SAMN03472549 BioSample; SAMN03472766 BioSample; SAMN10987914 ENCODE; ENCBS200HLU ENCODE; ENCBS266AAA ENCODE; ENCBS953RZO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307757
ChEMBL-Targets; CHEMBL615023 GDSC; 909776 PharmacoDB; U2OS_1619_2019 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSE54820 GEO; GSM170250 GEO; GSM185160 GEO; GSM185161 GEO; GSM287989 GEO; GSM287990 GEO; GSM320831 GEO; GSM827583 GEO; GSM879223 GEO; GSM887722 GEO; GSM888816 GEO; GSM1231597 GEO; GSM1231598 GEO; GSM1231599 GEO; GSM1231600 GEO; GSM1231601 GEO; GSM1231602 GEO; GSM1231603 GEO; GSM1231604 GEO; GSM1231605 GEO; GSM1231606 GEO; GSM1231607 GEO; GSM1231608 GEO; GSM1231609 GEO; GSM1231610 GEO; GSM1356565 GEO; GSM1356566 GEO; GSM1356567 GEO; GSM1356568 GEO; GSM1356569 GEO; GSM1356570 GEO; GSM1356571 GEO; GSM1356572 GEO; GSM1356573 GEO; GSM1356574 GEO; GSM1356575 GEO; GSM1356576 GEO; GSM1356577 GEO; GSM1356578 GEO; GSM1356579 GEO; GSM1356580 GEO; GSM1356581 GEO; GSM1356582 GEO; GSM1356583 GEO; GSM1356584 GEO; GSM1356585 GEO; GSM1356586 GEO; GSM1356587 GEO; GSM1670557 GEO; GSM1676324 GEO; GSM1701657 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS292 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q28473037 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687934
Cosmic; 755312 Cosmic; 909776 Cosmic; 931038 Cosmic; 931909 Cosmic; 1044081 Cosmic; 1044268 Cosmic; 1066238 Cosmic; 1074397 Cosmic; 1078392 Cosmic; 1082493 Cosmic; 1097758 Cosmic; 1529905 Cosmic; 1733128 Cosmic; 2009542 Cosmic; 2301583 Cosmic; 2440477 Cosmic; 2816207 IARC_TP53; 27710 LiGeA; CCLE_160 Progenetix; CVCL_0042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PRD000118
PRIDE; PXD000262 PRIDE; PXD000157 PRIDE; PXD000589 PRIDE; PXD000953 PRIDE; PXD000954 PRIDE; PXD001220 PRIDE; PXD002073 PRIDE; PXD002117 PRIDE; PXD002395 PRIDE; PXD003754 PRIDE; PXD009668 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |