Cell line name | AGS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_0139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: AGS (RRID:CVCL_0139) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: FGFR genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1034). Part of: JFCR45 cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: PI3K genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1028). Population: Caucasian. Characteristics: Persistently infected with parainfluenza virus type 5 (PIV5) strain PIV5-AGS (PubMed=17509637; PubMed=27445371). Doubling time: 24 hours (PubMed=1370612); 22 hours (PubMed=25984343); 24.16 +- 0.07 hours (PubMed=35122114); 20 hours (ATCC). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: ChIP-seq GATA4 analysis. Omics: ChIP-seq GATA6 analysis. Omics: ChIP-seq KLF5 analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Derived from sampling site: Stomach. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 54Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ATCC; BCRC; CCRID; CLS; Cosmic-CLP; ECACC; Genomics_Center_BCF_Technion; KCLB Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6831414 PubMed=1370612; DOI=10.1016/S0006-291X(05)80133-0 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50014-9 PubMed=10402490; DOI=10.3892/ijmm.4.2.203 PubMed=15767549; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-04-0234 PubMed=17509637; DOI=10.1016/j.virol.2007.03.061 PubMed=18804159; DOI=10.1016/j.ygeno.2008.08.002 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=27445371; DOI=10.1128/genomeA.00653-16 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=29717028; DOI=10.1042/BSR20180277 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 DOI=10.21203/rs.3.rs-1302156/v1 PubMed=35122114; DOI=10.1007/s00210-022-02217-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; C0023004/4958
ATCC; CRL-1739 BCRC; 60102 BCRJ; 0311 CCTCC; GDC0247 CLS; 300408 ECACC; 89090402 IBRC; C10071 IZSLER; BS TCL 135 KCB; KCB 200708YJ KCLB; 21739 NCBI_Iran; C131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471028
BioSample; SAMN03471416 BioSample; SAMN10988305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308078
ChEMBL-Targets; CHEMBL613860 GDSC; 906790 PharmacoDB; AGS_56_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54748713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
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Proteomic databases | PRIDE; PXD000722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
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Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 23-Jun-2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |