Cell line name | HOS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_0312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HOS (RRID:CVCL_0312) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Gene deletion; CDKN2A; Zygosity=Homozygous (PubMed=19787792).TP53 p.Arg156Pro (c.467G>C) (ClinVar=VCV000634768) (PubMed=19787792). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=15289353
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Osteosarcoma (NCIt: C9145) Osteosarcoma (ORDO: Orphanet_668) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 13Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CCRID; Cosmic-CLP; ECACC; JCRB; PubMed=19787792; RCB Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-420.html http://tcpaportal.org/mclp/ http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=38 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=2193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6954533; DOI=10.1073/pnas.79.7.2194 PubMed=2823272; DOI=10.1073/pnas.84.21.7716 PubMed=2463881; DOI=10.1093/carcin/10.2.265 PubMed=1385192; DOI=10.1016/0531-5565(92)90007-m PubMed=12645653; DOI=10.1016/S0165-4608(02)00685-4 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=15289353; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-04-0522 PubMed=19787792; DOI=10.1002/gcc.20717 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=21519327; DOI=10.1038/labinvest.2011.72 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=26320182; DOI=10.18632/oncotarget.5177 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-1543
BCRC; 60308 BCRJ; 0339 CCTCC; GDC0251 CCTCC; GDC0333 ECACC; 87070202 ICLC; HTL04003 IZSLER; BS TCL 69 JCRB; IFO50106 KCB; KCB 2015015YJ RCB; RCB0992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl1702
CLDB; cl1706 CLDB; cl7155 CCLE; HOS_BONE CCRID; 3111C0001CCC000038 CCRID; 3142C0001000000956 Cell_Model_Passport; SIDM00806 Cosmic-CLP; 907060 DepMap; ACH-000613 IGRhCellID; HOS LINCS_LDP; LCL-1421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0003904
CLO; CLO_0003795 CLO; CLO_0050810 EFO; EFO_0002196 MCCL; MCC:0000205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821560
BioSample; SAMN01821729 BioSample; SAMN03471393 BioSample; SAMN10987602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308811
ChEMBL-Targets; CHEMBL614736 GDSC; 907060 PharmacoDB; HOS_563_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM170248 GEO; GSM185087 GEO; GSM185088 GEO; GSM320827 GEO; GSM827319 GEO; GSM879208 GEO; GSM887088 GEO; GSM888159 GEO; GSM1669891 GEO; GSM1676300 GEO; GSM1701635 GEO; GSM1914984 GEO; GSM1914985 GEO; GSM1914986 GEO; GSM1914987 GEO; GSM1915023 GEO; GSM1915024 GEO; GSM2635315 GEO; GSM2635316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54890160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687928
Cosmic; 759899 Cosmic; 907060 Cosmic; 931037 Cosmic; 931910 Cosmic; 1044082 Cosmic; 1070840 Cosmic; 1074391 Cosmic; 1176621 Cosmic; 1529902 Cosmic; 2816208 IARC_TP53; 27020 LiGeA; CCLE_703 Progenetix; CVCL_0312 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |