Cell line name | JEG-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Jeg-3; JEG3; Jeg3; jeg3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: JEG-3 (RRID:CVCL_0363) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Characteristics: Established by serial cloning into hamster cheek pouches. Doubling time: ~24 hours (DSMZ); ~36 hours (CLS). Karyotypic information: Near tetraploid karyotype (PubMed=33096371). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Caution: A TP53 mutation is indicated as being at p.Gln167His (c.501G>T) in PubMed=7819056 but has not been confirmed by CCLE and Cosmic-CLP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gestational choriocarcinoma (NCIt: C4646) Gestational choriocarcinoma (ORDO: Orphanet_99926) Derived from metastatic site: Fetal brain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_0044 ! BeWo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Fetus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ATCC; CCRID; CLS; Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ; KCLB Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/j/cell-lines-detail-251.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=5103722; DOI=10.1210/jcem-32-5-683 PubMed=62839; DOI=10.1093/jnci/56.5.911 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=7459858 PubMed=6220172 PubMed=2878840; DOI=10.1016/0020-7292(86)90088-3 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=7937597; DOI=10.1016/0143-4004(94)90008-6 PubMed=7753552 PubMed=7819056; DOI=10.1038/bjc.1995.3 DOI=10.1007/0-306-46861-1_8 PubMed=11994546; DOI=10.1093/molehr/8.5.485 PubMed=12966428; DOI=10.1038/sj.bjc.6601212 PubMed=16797695; DOI=10.1016/j.placenta.2006.05.001 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28161053; DOI=10.1016/j.placenta.2016.12.007 PubMed=28724925; DOI=10.1038/s41598-017-06364-z PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=33096371; DOI=10.1016/j.placenta.2020.10.011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; C0030003/4940
ATCC; HTB-36 BCRC; 60428 BCRJ; 0123 CCTCC; GDC0320 CLS; 300222 DSMZ; ACC-463 ECACC; 92120308 IZSLER; BS TCL 181 KCLB; 30036 NCBI_Iran; C544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007017
MCCL; MCC:0000257 CLDB; cl2935 CLDB; cl2936 CCRID; 1101HUM-PUMC000071 CCRID; 3101HUMTCHu195 CCRID; 4201HUM-CCTCC00320 Cell_Model_Passport; SIDM01218 Cosmic-CLP; 907176 DepMap; ACH-001530 DSMZCellDive; ACC-463 IGRhCellID; JEG3 LINCS_LDP; LCL-1492 TOKU-E; 2070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821538
BioSample; SAMN01821638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308202
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366348 GDSC; 907176 PharmacoDB; JEG3_677_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54898563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM48266 GEO; GSM48267 GEO; GSM48268 GEO; GSM1669948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 683654
Cosmic; 907176 Cosmic; 1312288 Cosmic; 2077192 IARC_TP53; 4344 IARC_TP53; 21418 Progenetix; CVCL_0363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 23-Jun-2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |