Cell line name | LA-N-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LAN-5; Lan-5; LAN5; Lan5; NBLAN5T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LA-N-5 (RRID:CVCL_0389) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Doubling time: ~100 hours (DSMZ). Omics: Array-based CGH. Omics: ATAC-seq. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Miscellaneous: On the basis that LA-350 (CVCL_AR50) and LA-N-5 are both established by Seeger R.C., that they share identical STR profiles and that LA-350 is said to originate from a patient suffering from neuroblastoma we have annotated them as being autologous cell lines. Misspelling: LAN-3; In Cosmic 920242. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | ALK p.Arg1275Gln (c.3824G>A) (ClinVar=VCV000018083) (PubMed=18724359; PubMed=28350380). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) Derived from metastatic site: Bone marrow. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Originate from same individual | CVCL_AR50 ! LA-350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 4M | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): COG; DSMZ; RCB Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cogcell.org/dl/NB_Data_Sheets/LA-N-5_Cell_Line_Data_Sheet_COGcell_org.pdf http://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/l/cell-lines-detail-481.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6172518 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261 PubMed=18923524; DOI=10.1038/nature07399 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=22213050; DOI=10.1002/ijc.27415 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493 PubMed=24466371; DOI=10.1593/tlo.13544 PubMed=24792489; DOI=10.1007/s11060-014-1456-8 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-673
ICLC; HTL96022 - Discontinued NCBI_Iran; C613 RCB; RCB0485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl3170
CLDB; cl3171 LINCS_LDP; LCL-1987 Lonza; 1157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0000935
CLO; CLO_0007242 CLO; CLO_0050264 MCCL; MCC:0000284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472329
BioSample; SAMN03473428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
GEO; GSM313804 GEO; GSM333799 GEO; GSM692871 GEO; GSM2371239 GEO; GSM2394369 GEO; GSM4104579 GEO; GSM4104580 GEO; GSM4104628 GEO; GSM4104629 GEO; GSM4105313 GEO; GSM4105314 GEO; GSM4105315 GEO; GSM4105316 GEO; GSM4105317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54901878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 801742
Cosmic; 920242 Cosmic; 923828 Cosmic; 930066 Cosmic; 947705 Cosmic; 1037345 Cosmic; 1099142 Cosmic; 1109122 Cosmic; 1153783 Cosmic; 1161992 Cosmic; 1167989 Cosmic; 1212538 Cosmic; 1518068 Cosmic; 1526629 Cosmic; 1890201 Cosmic; 2131580 Cosmic; 2239462 Cosmic; 2301576 Cosmic; 2393636 IARC_TP53; 21459 Progenetix; CVCL_0389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |