Cell line name | MDA-MB-435S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MDA-MB-435s; MDA-MB-435 S; MDA-MB-435-S; MDAMB435S; BrCL15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MDA-MB-435S (RRID:CVCL_0622) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Parent cell line (MDA-MB-435) has been shown to be a M14 derivative. Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00565. Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for BRAF p.Val600Glu (c.1799T>A) (ClinVar=VCV000013961) (PubMed=19593635; CCLE).Heterozygous for CDKN2A c.150+2T>C (IVS1+2T>C) (ClinVar=VCV000406712); Note=Splice donor mutation (PubMed=19593635).Heterozygous for CDKN2A c.455insCdel26 (PubMed=19593635).Hemizygous for EP300 p.Leu827Pro (c.2480T>C) (PubMed=10700188).Hemizygous for EP300 p.Glu1013Gly (c.3038A>G) (PubMed=10700188).Heterozygous for TP53 p.Gly266Glu (c.797G>A) (ClinVar=VCV000161516) (PubMed=16541312; CCLE). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Amelanotic melanoma (NCIt: C3802) Derived from metastatic site: Subcutaneous; right buttock. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Parent: CVCL_0417 (MDA-MB-435) Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 33Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CCRID; CLS; PubMed=28940260 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.atcc.org/support/faqs/91699/ATCC%20HTB-129%20Derivative-1051.aspx https://www.atcc.org/support/faqs/79d25/Morphology%20of%20ATCC%20HTB-129-495.aspx http://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v10_distribution.xlsx http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=15 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=606 http://www.cellresource.cn/fdetail.aspx?id=820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50009-5 PubMed=10700188; DOI=10.1038/73536 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=16397213; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-05-2853 PubMed=16541312; DOI=10.1007/s10549-006-9186-z PubMed=19593635; DOI=10.1007/s10549-009-0460-8 PubMed=20070913; DOI=10.1186/1471-2407-10-15 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=23601657; DOI=10.1186/bcr3415 PubMed=28940260; DOI=10.1002/ijc.31067 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; HTB-129
BCRJ; 0165 CCTCC; GDC0053 CLS; 300277/NA - Discontinued ICLC; HTL03006 KCB; KCB 200773YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl7142
CCLE; MDAMB435S_SKIN CCRID; 3111C0001CCC000015 CCRID; 3131C0001000700036 CCRID; 3142C0001000000052 Cell_Model_Passport; SIDM01222 DepMap; ACH-000884 LINCS_HMS; 50030 LINCS_LDP; LCL-1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0003941
CLO; CLO_0007638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10987989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM149983 GEO; GSM149991 GEO; GSM149999 GEO; GSM421877 GEO; GSM887298 GEO; GSM888373 GEO; GSM1374657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54904637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 809237
Cosmic; 871155 Cosmic; 894089 Cosmic; 904381 Cosmic; 1044202 Cosmic; 1046951 Cosmic; 1287922 Cosmic; 1289399 Cosmic; 1523969 Cosmic; 1609477 Cosmic; 2301531 LiGeA; CCLE_408 Progenetix; CVCL_0622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD016837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |