Cell line name | CAL-148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CAL 148; CAL148; Centre Antoine Lacassagne-148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-148 (RRID:CVCL_1106) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Doubling time: ~30-40 hours (DSMZ); 42.78 hours (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2347014). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for TP53 p.Glu224Lys (c.670G>A) (ClinVar=VCV000480767) (Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) Derived from metastatic site: Pleural effusion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 http://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7531416 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; CAL148_BREAST
Cell_Model_Passport; SIDM00938 Cosmic-CLP; 924106 DepMap; ACH-000902 LINCS_HMS; 51111 LINCS_LDP; LCL-1464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0002181
EFO; EFO_0005357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471761
BioSample; SAMN10988460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308794
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075407 GDSC; 924106 PharmacoDB; CAL148_167_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM274695 GEO; GSM344383 GEO; GSM344433 GEO; GSM783978 GEO; GSM827186 GEO; GSM886906 GEO; GSM887971 GEO; GSM1172945 GEO; GSM1669647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54808386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 924106
Cosmic; 1603194 Cosmic; 2164985 IARC_TP53; 27145 LiGeA; CCLE_805 Progenetix; CVCL_1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |