Cell line name | CAL-85-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Cal-85-1; CAL 85-1; CAL85-1; CAL851; Centre Antoine Lacassagne-85-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-85-1 (RRID:CVCL_1114) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Doubling time: ~70 hours (DSMZ); 99.85 hours (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2347014). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for BRCA2 p.Ser1461Profs*2 (c.4381delT) (CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for TP53 p.Lys132Glu (c.394A>G) (ClinVar=VCV000376626) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 35Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 http://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7531416 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; CAL851_BREAST
Cell_Model_Passport; SIDM00928 Cosmic-CLP; 910852 DepMap; ACH-000857 LINCS_HMS; 51112 LINCS_LDP; LCL-1465 Lonza; 1212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0002190
EFO; EFO_0005359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473094
BioSample; SAMN10988345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308700
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075415 GDSC; 910852 PharmacoDB; CAL851_177_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM274639 GEO; GSM344363 GEO; GSM344413 GEO; GSM827163 GEO; GSM847247 GEO; GSM847457 GEO; GSM843484 GEO; GSM843485 GEO; GSM886913 GEO; GSM887979 GEO; GSM1172947 GEO; GSM1669657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54808414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910852
Cosmic; 2164987 IARC_TP53; 21215 LiGeA; CCLE_496 Progenetix; CVCL_1114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |