Cell line name | DBTRG-05MG | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | DBTRG.05MG; DBTRG05MG; DBTRG | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: DBTRG-05MG (RRID:CVCL_1169) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: 54 hours (PubMed=25984343); ~48 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for BRAF p.Val600Glu (c.1799T>A) (ClinVar=VCV000013961) (PubMed=12068308; ATCC; CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Anaplastic astrocytoma (NCIt: C9477) Anaplastic astrocytoma (ORDO: Orphanet_251589) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ; ECACC Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-2020
BCRC; 60380 DSMZ; ACC-359 ECACC; 93061119 ICLC; HTL98001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl1005
CLDB; cl1006 CCLE; DBTRG05MG_CENTRAL_NERVOUS_SYSTEM Cell_Model_Passport; SIDM00867 Cosmic-CLP; 906835 DepMap; ACH-000863 IGRhCellID; DBTRG05MG LINCS_LDP; LCL-1349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0002722
CLO; CLO_0002723 EFO; EFO_0002159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471277
BioSample; SAMN03473317 BioSample; SAMN10988246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308485
ChEMBL-Targets; CHEMBL614801 GDSC; 906835 PharmacoDB; DBTRG05MG_285_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326248 GEO; GSM886974 GEO; GSM888043 GEO; GSM1669728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54828614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685871
Cosmic; 850827 Cosmic; 906835 Cosmic; 1746961 Cosmic; 2302326 Cosmic; 2367523 Cosmic; 2516015 LiGeA; CCLE_313 Progenetix; CVCL_1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |