Cell line name | EGI-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Egi-1; EGI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EGI-1 (RRID:CVCL_1193) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: >45 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for KRAS p.Gly12Asp (c.35G>A) (ClinVar=VCV000012582) (CCLE; Cosmic-CLP).Homozygous for TP53 p.Arg273His (c.818G>A) (ClinVar=VCV000012366) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cholangiocarcinoma (NCIt: C4436) Cholangiocarcinoma (ORDO: Orphanet_70567) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 CLPUB00275 PubMed=27231123; DOI=10.1158/2159-8290.CD-15-1442 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=32899426; DOI=10.3390/cancers12092510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; EGI1_BILIARY_TRACT
Cell_Model_Passport; SIDM01050 Cosmic-CLP; 906853 DepMap; ACH-001494 LINCS_LDP; LCL-1787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0002895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308731
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075442 GDSC; 906853 PharmacoDB; EGI1_327_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54832088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 906853
Cosmic; 927186 Cosmic; 1373548 Cosmic; 2674064 IARC_TP53; 21324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |