Cell line name | EM-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | EM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EM-2 (RRID:CVCL_1196) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: 2 days (CelloPub=CLPUB00038); ~35-40 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Derived from sampling site: Bone marrow. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: DSMZ
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood chronic myelogenous leukemia, BCR-ABL1 positive (NCIt: C7320) Chronic myeloid leukemia (ORDO: Orphanet_521) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Originate from same individual | CVCL_2033 ! EM-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 5Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | CLPUB00038 PubMed=3856862; DOI=10.1073/pnas.82.6.1810 PubMed=3332852; DOI=10.1016/S0950-3536(87)80037-9 PubMed=10071072; DOI=10.1016/s0145-2126(98)00171-4 PubMed=10637496; DOI=10.1038/sj.leu.2401604 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=20809971; DOI=10.1186/1755-8166-3-15 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002922
CLDB; cl1164 Cell_Model_Passport; SIDM01047 Cosmic-CLP; 906855 DepMap; ACH-000295 DSMZCellDive; ACC-135 IGRhCellID; EM2 LINCS_LDP; LCL-1112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472895
BioSample; SAMN10988561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308889
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366281 GDSC; 906855 PharmacoDB; EM2_331_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54832264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM887004 GEO; GSM888073 GEO; GSM1374474 GEO; GSM1669762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 787491
Cosmic; 906855 Cosmic; 994175 Cosmic; 1026572 Cosmic; 1078728 Cosmic; 1498416 IARC_TP53; 340 IARC_TP53; 21326 LiGeA; CCLE_641 Progenetix; CVCL_1196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 23-Jun-2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |