Cell line name | GAK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Accession | CVCL_1225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GAK (RRID:CVCL_1225) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 72 hours, ~32 hours (lot 02242012), ~55 hours (lot 07202012) (JCRB). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Vulvar melanoma (NCIt: C40329) Derived from metastatic site: Inguinal lymph node. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 86Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; JCRB; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6431036 PubMed=15467732; DOI=10.1038/sj.onc.1208152 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | JCRB; IFO50321
JCRB; JCRB0180 JCRB; FDSC0034 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; GAK_SKIN
Cell_Model_Passport; SIDM00543 CGH-DB; 9290-4 Cosmic-CLP; 910932 DepMap; ACH-002120 LINCS_LDP; LCL-1272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308154
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366301 GDSC; 910932 PharmacoDB; GAK_397_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54835424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 905204
Cosmic; 910932 Cosmic; 1995410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |