Cell line name | HCC1143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-1143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC1143 (RRID:CVCL_1245) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Triple negative breast cancer (TNBC) cell line. Part of: AKT genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1029). Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Doubling time: ~45-60 hours (DSMZ); 54.63 hours (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2347014). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Glycoproteome analysis by proteomics. Omics: HLA class I peptidome analysis by proteomics. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Homozygous for TP53 p.Arg248Gln (c.743G>A) (ClinVar=VCV000012356) (PubMed=28889351; ATCC). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Ductal breast carcinoma (NCIt: C4017) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Originate from same individual | CVCL_1246 ! HCC1143 BL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; DSMZ; DOI=10.4172/2157-7145.S2-005; PubMed=25877200; PubMed=28889351 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.pawefish.path.cam.ac.uk/BreastCellLineDescriptions/HCC1143.html http://dpsc.ccbr.utoronto.ca/cancer/get_cellline.pl?cellline=HCC1143 http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 http://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9833771; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19981209)78:6<766::AID-IJC15>3.0.CO;2-L PubMed=9865903 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=16959974; DOI=10.1126/science.1133427 PubMed=17157791; DOI=10.1016/j.ccr.2006.10.008 PubMed=17932254; DOI=10.1126/science.1145720 PubMed=19582160; DOI=10.1371/journal.pone.0006146 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=21778573; DOI=10.3233/BD-2010-0307 DOI=10.4172/2157-7145.S2-005 PubMed=22414580; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-11-3711 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=22585861; DOI=10.1158/2159-8290.CD-11-0224 PubMed=23151021; DOI=10.1186/1471-2164-13-619 PubMed=23601657; DOI=10.1186/bcr3415 PubMed=24094812; DOI=10.1016/j.ccr.2013.08.020 PubMed=24162158; DOI=10.1007/s10549-013-2743-3 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25576301; DOI=10.1074/mcp.M114.042812 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=28287265; DOI=10.1021/acs.jproteome.6b00470 PubMed=28889351; DOI=10.1007/s10549-017-4496-x PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-2321
DSMZ; ACC-517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; HCC1143_BREAST
Cell_Model_Passport; SIDM00866 Cosmic-CLP; 749710 DepMap; ACH-000374 IGRhCellID; HCC1143 LINCS_HMS; 50205 LINCS_LDP; LCL-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0003630
EFO; EFO_0001169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821553
BioSample; SAMN01821627 BioSample; SAMN03471844 BioSample; SAMN10987917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308737
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075453 GDSC; 749710 PharmacoDB; HCC1143_466_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-TABM-157 GEO; GSE82032 GEO; GSM184404 GEO; GSM184405 GEO; GSM217570 GEO; GSM274677 GEO; GSM303672 GEO; GSM303674 GEO; GSM303676 GEO; GSM303677 GEO; GSM303678 GEO; GSM303679 GEO; GSM303681 GEO; GSM303683 GEO; GSM303685 GEO; GSM303686 GEO; GSM303688 GEO; GSM303690 GEO; GSM303692 GEO; GSM303693 GEO; GSM303694 GEO; GSM303696 GEO; GSM303697 GEO; GSM303699 GEO; GSM303701 GEO; GSM303702 GEO; GSM303703 GEO; GSM303705 GEO; GSM303706 GEO; GSM303708 GEO; GSM303710 GEO; GSM303711 GEO; GSM303713 GEO; GSM303714 GEO; GSM303716 GEO; GSM303717 GEO; GSM303718 GEO; GSM303720 GEO; GSM303722 GEO; GSM303724 GEO; GSM303725 GEO; GSM303727 GEO; GSM303728 GEO; GSM303730 GEO; GSM303732 GEO; GSM303733 GEO; GSM303734 GEO; GSM303736 GEO; GSM303737 GEO; GSM303739 GEO; GSM303741 GEO; GSM303743 GEO; GSM303744 GEO; GSM303746 GEO; GSM303748 GEO; GSM303749 GEO; GSM303751 GEO; GSM303752 GEO; GSM303755 GEO; GSM303756 GEO; GSM303757 GEO; GSM303758 GEO; GSM303759 GEO; GSM303761 GEO; GSM303763 GEO; GSM303764 GEO; GSM303765 GEO; GSM303767 GEO; GSM303768 GEO; GSM303771 GEO; GSM303772 GEO; GSM303773 GEO; GSM303774 GEO; GSM303776 GEO; GSM303778 GEO; GSM303779 GEO; GSM303781 GEO; GSM303782 GEO; GSM303783 GEO; GSM303785 GEO; GSM303787 GEO; GSM303788 GEO; GSM303790 GEO; GSM337641 GEO; GSM337642 GEO; GSM337643 GEO; GSM337644 GEO; GSM337645 GEO; GSM337646 GEO; GSM337647 GEO; GSM337648 GEO; GSM337649 GEO; GSM337650 GEO; GSM337651 GEO; GSM337652 GEO; GSM337653 GEO; GSM337654 GEO; GSM337655 GEO; GSM337656 GEO; GSM337657 GEO; GSM337658 GEO; GSM337659 GEO; GSM337660 GEO; GSM337661 GEO; GSM344378 GEO; GSM344428 GEO; GSM350550 GEO; GSM481298 GEO; GSM533400 GEO; GSM533407 GEO; GSM537970 GEO; GSM783932 GEO; GSM847319 GEO; GSM844541 GEO; GSM854615 GEO; GSM854616 GEO; GSM854617 GEO; GSM854618 GEO; GSM854619 GEO; GSM887033 GEO; GSM888103 GEO; GSM1008895 GEO; GSM1053704 GEO; GSM1172954 GEO; GSM1172861 GEO; GSM1214576 GEO; GSM1215281 GEO; GSM1215282 GEO; GSM1215283 GEO; GSM1215287 GEO; GSM1215284 GEO; GSM1215285 GEO; GSM1215286 GEO; GSM1215288 GEO; GSM1374493 GEO; GSM1401661 GEO; GSM1669841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54881530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 749710
Cosmic; 904360 Cosmic; 1047708 Cosmic; 1176639 Cosmic; 1235079 Cosmic; 1287934 Cosmic; 1430347 Cosmic; 1460230 Cosmic; 1473032 Cosmic; 1518109 Cosmic; 1603198 Cosmic; 1935003 Cosmic; 2009509 Cosmic; 2164989 IARC_TP53; 21359 IARC_TP53; 22809 IARC_TP53; 30200 LiGeA; CCLE_262 Progenetix; CVCL_1245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000309
PRIDE; PXD000394 PRIDE; PXD002486 PRIDE; PXD005295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |