Cell line name | IPC-298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | IPC 298; IPC298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: IPC-298 (RRID:CVCL_1307) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: 34 hours (PubMed=8325707); ~30 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Homozygous for CDKN2A p.Arg99Pro (c.296G>C) (ClinVar=VCV000491572) (PubMed=9354451; CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for NRAS p.Gln61Leu (c.182A>T) (ClinVar=VCV000375874) (CCLE; Cosmic-CLP).TERT c.1-146C>T (c.250C>T) (C250T); Note=In promoter (PubMed=31068700).Homozygous for TP53 p.Arg213Ter (c.637C>T) (ClinVar=VCV000043590) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cutaneous melanoma (NCIt: C3510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 64Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8325707; DOI=10.1002/ijc.2910540513 PubMed=9354451 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl2901
CCLE; IPC298_SKIN Cell_Model_Passport; SIDM01059 Cosmic-CLP; 907171 DepMap; ACH-000915 LINCS_LDP; LCL-1250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0005774
CLO; CLO_0006961 EFO; EFO_0006447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471908
BioSample; SAMN10988211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308797
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075480 GDSC; 907171 PharmacoDB; IPC298_666_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887163 GEO; GSM888235 GEO; GSM1669940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54897951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907171
Cosmic; 928731 IARC_TP53; 21397 LiGeA; CCLE_533 Progenetix; CVCL_1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |