Cell line name | LA-N-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LAN-6; LAN6; LA-N-6(OAN) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LA-N-6 (RRID:CVCL_1363) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Characteristics: Neuroblastic type (N-type) (PubMed=15720811). Doubling time: ~1 week (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Deep tyrosine phosphoproteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for ALK p.Asp1091Asn (c.3271G>A) (ClinVar=VCV000218628) (PubMed=18724359; CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for KRAS p.Gly12Cys (c.34G>T) (ClinVar=VCV000012578) (CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for TP53 p.Pro152Leu (c.455C>T) (ClinVar=VCV000142766) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) Derived from metastatic site: Bone marrow. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 6Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): COG; Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cogcell.org/dl/NB_Data_Sheets/LA-N-6_Cell_Line_Data_Sheet_COGcell_org.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8242562; DOI=10.1002/1097-0142(19931201)72:11<3346::AID-CNCR2820721134>3.0.CO;2-E DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=11507071 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=15720811; DOI=10.1593/neo.04310 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493 PubMed=24792489; DOI=10.1007/s11060-014-1456-8 PubMed=25884760; DOI=10.1371/journal.pcbi.1004130 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; LAN6_AUTONOMIC_GANGLIA
Cell_Model_Passport; SIDM00330 Cosmic-CLP; 949170 DepMap; ACH-001355 LINCS_LDP; LCL-1988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308206
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366123 GDSC; 949170 PharmacoDB; LAN6_819_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1670032 GEO; GSM2371240 GEO; GSM2394373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54901879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 697283
Cosmic; 717430 Cosmic; 848929 Cosmic; 930067 Cosmic; 949170 Cosmic; 1019942 Cosmic; 1109105 Cosmic; 1109366 Cosmic; 1161993 Cosmic; 1167408 Cosmic; 1526630 Cosmic; 1890102 Cosmic; 2301577 Cosmic; 2393637 IARC_TP53; 23822 IARC_TP53; 27562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |