Cell line name | LN-405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LN 405; LN405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LN-405 (RRID:CVCL_1378) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: ~60 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for EGFR p.Leu62Arg (c.185T>G) (CCLE; Cosmic-CLP).Homozygous for PTEN p.Arg173Cys (c.517C>T) (ClinVar=VCV000189500) (CCLE; Cosmic-CLP).Homozygous for TP53 p.Arg282Trp (c.844C>T) (ClinVar=VCV000012364) (PubMed=10416987; CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Glioblastoma (NCIt: C3058) Glioblastoma (ORDO: Orphanet_360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 61Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=11416159; PubMed=22570425 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10416987; DOI=10.1111/j.1750-3639.1999.tb00536.x PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=21406405; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-3112 PubMed=22570425; DOI=10.1093/neuonc/nos072 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl3242
CCLE; LN405_CENTRAL_NERVOUS_SYSTEM Cell_Model_Passport; SIDM00343 Cosmic-CLP; 910694 DepMap; ACH-002268 LINCS_LDP; LCL-1395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0007364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308756
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075491 GDSC; 910694 PharmacoDB; LN405_845_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326241 GEO; GSM1670050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54902781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687578
Cosmic; 849868 Cosmic; 910694 Cosmic; 1746949 Cosmic; 2302332 Cosmic; 2367536 Cosmic; 2580914 IARC_TP53; 21474 Progenetix; CVCL_1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |