Cell line name | NCC-IT | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | NCCIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCC-IT (RRID:CVCL_1451) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Misspelling: NCC15; In PubMed=24812411 and Cosmic 2163758. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | MAP2K4 p.Lys309Asn (c.927G>C) (PubMed=9331070).Homozygous for TP53 p.Val272Cysfs*73 (c.814delG) (CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for PTEN p.Arg173Pro (c.518G>C) (ClinVar=VCV000185195) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Testicular embryonal carcinoma (NCIt: C6341) Non-central nervous system-localized embryonal carcinoma (ORDO: Orphanet_289362) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 24Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; DepMap; Cosmic-CLP Markers:
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Web pages | https://de.wikipedia.org/wiki/NCC-IT | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2842544 PubMed=9331070 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31500094; DOI=10.3390/cancers11091316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-2073
BCRC; 60314 BCRJ; 0369 NCBI_Iran; C624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; NCCIT_TESTIS
Cell_Model_Passport; SIDM00655 Cosmic-CLP; 908441 DepMap; ACH-001578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0004180
CLO; CLO_0007955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308379
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075511 PharmacoDB; NCCIT_999_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
GEO; GSM1670159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q17578676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687051
Cosmic; 908441 Cosmic; 1090412 Cosmic; 2077186 Cosmic; 2163758 Cosmic; 2807074 IARC_TP53; 21532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |