Cell line name | RPMI-2650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RPMI 2650; RPMI2650; Roswell Park Memorial Institute 2650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RPMI-2650 (RRID:CVCL_1664) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Doubling time: ~40-50 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Misspelling: CCL30; Based on the ATCC catalog number. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Gene fusion; BRD4-NUTM1 (BRD4-NUT) (PubMed=25485619). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Head and neck squamous cell carcinoma (NCIt: C34447) Derived from metastatic site: Pleural effusion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CLS; Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ; ECACC; JCRB; KCLB; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=5831238; DOI=10.1016/0014-4827(65)90022-4 DOI=10.1007/978-1-4757-1647-4_13 PubMed=174085; DOI=10.1073/pnas.72.12.4971 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6277475 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50007-1 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CCL-30
BCRC; 60296 CLS; 300323/p769_RPMI_2650 DSMZ; ACC-287 ECACC; 88031602 IZSLER; BS TCL 59 JCRB; JCRB9058 KCLB; 10030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl4174
CLDB; cl4175 CLDB; cl4176 CCLE; RPMI2650_UPPER_AERODIGESTIVE_TRACT Cell_Model_Passport; SIDM00809 Cosmic-CLP; 909700 DepMap; ACH-001385 IGRhCellID; RPMI2650%20GSE9585 LINCS_LDP; LCL-1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0004205
CLO; CLO_0008869 CLO; CLO_0008876 EFO; EFO_0006478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821660
BioSample; SAMN01821717 BioSample; SAMN03473151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308780
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075566 GDSC; 909700 PharmacoDB; RPMI2650_1324_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1374853 GEO; GSM1374854 GEO; GSM1670386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54951175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 686978
Cosmic; 909700 Cosmic; 1006465 Cosmic; 1017789 Cosmic; 1041670 Cosmic; 1339925 Cosmic; 2043886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |