Cell line name | RVH-421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | RVH 421; RVH421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RVH-421 (RRID:CVCL_1672) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: ~54 hours (PubMed=6838761); ~50-60 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for BRAF p.Val600Glu (c.1799T>A) (ClinVar=VCV000013961) (CCLE; Cosmic-CLP).TERT c.1-146C>T (c.250C>T) (C250T); Note=In promoter (PubMed=31068700).Heterozygous for TP53 p.Gln52fs*71 (c.154delC) (CCLE; Cosmic-CLP). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Melanoma (NCIt: C3224) Derived from metastatic site: Brain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 28Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6838761 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl4207
CCLE; RVH421_SKIN Cell_Model_Passport; SIDM00401 Cosmic-CLP; 909706 DepMap; ACH-000614 LINCS_HMS; 50475 LINCS_LDP; LCL-1255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0008902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472885
BioSample; SAMN03473412 BioSample; SAMN10987605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308126
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075567 GDSC; 909706 PharmacoDB; RVH421_1335_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887554 GEO; GSM888637 GEO; GSM1670395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54951478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 909706
IARC_TP53; 21295 Progenetix; CVCL_1672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 26 |