Cell line name | OCI-AML-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OCI/AML-3; OCI-AML3; OCI/AML3; OCI AML3; OCIAML3; Ontario Cancer Institute-Acute Myeloid Leukemia-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OCI-AML-3 (RRID:CVCL_1844) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Doubling time: 28 hours (PubMed=25984343); ~35-40 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Derived from sampling site: Peripheral blood. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for DNMT3A p.Arg882Cys (c.2644C>T) (ClinVar=VCV000375882) (PubMed=26434589; PubMed=31160637; PubMed=31739141; CCLE; Cosmic-CLP).Homozygous for NRAS p.Gln61Leu (c.182A>T) (ClinVar=VCV000375874) (CCLE; Cosmic-CLP).Heterozygous for NPM1 p.Trp288Cysfs*12 (c.860_863dupTCTG) (ClinVar=VCV000013998) (PubMed=16079892). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute myeloid leukemia (NCIt: C9154) Acute myeloid leukemia (ORDO: Orphanet_519) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 57Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2538684 PubMed=16079892; DOI=10.1038/sj.leu.2403899 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=21552520; DOI=10.1371/journal.pone.0019169 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26434589; DOI=10.1038/onc.2015.359 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28109323; DOI=10.1186/s13045-017-0396-0 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x PubMed=31739141; DOI=10.1016/j.leukres.2019.106270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | CCTCC; GDC0216
DSMZ; ACC-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; OCIAML3_HAEMATOPOIETIC_AND_LYMPHOID_TISSUE
Cell_Model_Passport; SIDM00462 Cosmic-CLP; 1290455 DepMap; ACH-000336 LINCS_LDP; LCL-1066 Lonza; 530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0004620
EFO; EFO_0006289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473107
BioSample; SAMN10988470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1290455
PharmacoDB; OCIAML3_1184_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM482512 GEO; GSM887469 GEO; GSM888549 GEO; GSM1446756 GEO; GSM1525022 GEO; GSM1670296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54931742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 787467
Cosmic; 975289 Cosmic; 1012110 Cosmic; 1127258 Cosmic; 1245831 Cosmic; 1319546 Cosmic; 1557602 Cosmic; 1582387 Cosmic; 1696140 Cosmic; 1779129 Cosmic; 2131552 Cosmic; 2306232 Cosmic; 2750869 LiGeA; CCLE_569 Progenetix; CVCL_1844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |