Cell line name | OCI-Ly7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OCI-LY7; OCI-LY-7; OCI-Ly-7; Oci-Ly-7; OCI-Ly 7; OCI-Ly07; OCILY7; Ly7; LY7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OCI-Ly7 (RRID:CVCL_1881) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Ontario Cancer Institute (OCI); Toronto; Canada. Characteristics: Genetic heterogeneous, consists of 2 subclones (PubMed=27566572). Doubling time: ~20-24 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Derived from sampling site: Peripheral blood. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Diffuse large B-cell lymphoma germinal center B-cell type (NCIt: C36080) Diffuse large B-cell lymphoma (ORDO: Orphanet_544) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 48Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.innovationbridge.com/uhn/diffuse-large-b-cell-lymphoma-cell-lines?categories=32&communities=5&forums=&organizations=&tags= https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3567358; DOI=10.1182/blood.V69.5.1307.1307 PubMed=8574164; DOI=10.3109/10428199509059672 PubMed=11807979; DOI=10.1002/gcc.10025 PubMed=15126345; DOI=10.1158/0008-5472.can-03-3773 PubMed=19278952; DOI=10.1182/blood-2009-01-202028 PubMed=19358282; DOI=10.1002/ijc.24351 PubMed=23292937; DOI=10.1073/pnas.1205299110 PubMed=23699601; DOI=10.1182/blood-2013-02-483727 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=27566572; DOI=10.18632/oncotarget.11524 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM00459
Cosmic-CLP; 1659819 DepMap; ACH-001617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473439
ENCODE; ENCBS006VZG ENCODE; ENCBS040MJM ENCODE; ENCBS062JSC ENCODE; ENCBS121JKZ ENCODE; ENCBS141AMI ENCODE; ENCBS182NFY ENCODE; ENCBS304FAI ENCODE; ENCBS581USS ENCODE; ENCBS699NWP ENCODE; ENCBS865AAA ENCODE; ENCBS866AAA ENCODE; ENCBS886BJZ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1659819
PharmacoDB; OCILY7_1187_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM380135 GEO; GSM552453 GEO; GSM562825 GEO; GSM1035333 GEO; GSM1059809 GEO; GSM1374789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1329092
Cosmic; 1517649 Cosmic; 1541903 Cosmic; 1629934 Cosmic; 1945199 Cosmic; 2276331 Progenetix; CVCL_1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 16-Dec-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |