Cell line name | CL-34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CL34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CL-34 (RRID:CVCL_1980) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Doubling time: ~70 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=25926053; PubMed=28683746); Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | BRAF p.Val600Glu (c.1799T>A) (PubMed=28683746).TP53 p.Ser127Pro (c.379T>C) and p.Lys382fs (PubMed=28683746). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200; PubMed=25926053 Markers:
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Web pages | http://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=19003396; DOI=10.1023/A:1008131428992 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=28683746; DOI=10.1186/s12943-017-0691-y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; CL34_LARGE_INTESTINE
ColonAtlas; CL34 Cosmic-CLP; 1290771 GDSC; 1290771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | EFO; EFO_0006369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471564
BioSample; SAMN03473518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM206456 GEO; GSM274835 GEO; GSM513933 GEO; GSM514185 GEO; GSM886935 GEO; GSM888001 GEO; GSM1448119 GEO; GSM2549991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54813478 |