Cell line name | MT-3 [Human contaminated breast cancer] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MT-3 [Human contaminated breast cancer] (RRID:CVCL_2129) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a LS174T derivative. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00506. Doubling time: ~30 hours (DSMZ). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=12661003; PubMed=15677628). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | CTNNB1 p.Ser45Phe (c.134C>T) (ClinVar=VCV000017588) (from parent cell line).Heterozygous for KRAS p.Gly12Asp (c.35G>A) (ClinVar=VCV000012582) (from parent cell line).PIK3CA p.His1047Arg (c.3140A>G) (ClinVar=VCV000013652) (from parent cell line). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Parent: CVCL_1384 (LS174T) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.pawefish.path.cam.ac.uk/BreastCellLineDescriptions/MT-3.html http://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v10_distribution.xlsx http://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1446057; DOI=10.1007/BF01831480 PubMed=9150904; DOI=10.1023/A:1005756632293 PubMed=11044355; DOI=10.1054/bjoc.2000.1458 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=12800145; DOI=10.1002/gcc.10218 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | IGRhCellID; MT3
LINCS_HMS; 50031 LINCS_LDP; LCL-1473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | CLO; CLO_0007890
EFO; EFO_0002241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472975
BioSample; SAMN03473582 BioSample; SAMN06481118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; MT3_969_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 GEO; GSM115102 GEO; GSM217592 GEO; GSM412073 GEO; GSM412084 GEO; GSM412093 GEO; GSM412098 GEO; GSM412106 GEO; GSM412110 GEO; GSM459700 GEO; GSM474280 GEO; GSM474281 GEO; GSM476484 GEO; GSM476485 GEO; GSM478311 GEO; GSM478312 GEO; GSM478314 GEO; GSM478315 GEO; GSM478320 GEO; GSM478321 GEO; GSM783977 GEO; GSM847419 GEO; GSM847498 GEO; GSM844610 GEO; GSM1172986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54906937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Progenetix; CVCL_2129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 24 |