Cell line name | SET-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Set-2; Set2; SET2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SET-2 (RRID:CVCL_2187) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Japanese. Doubling time: ~36 hours (PubMed=10637490); ~60-80 hours (DSMZ). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Derived from sampling site: Peripheral blood. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute megakaryoblastic leukemia (NCIt: C7965) Acute megakaryoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_518) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 71Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10637490; DOI=10.1038/sj.leu.2401608 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x PubMed=31739141; DOI=10.1016/j.leukres.2019.106270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM00397
Cosmic-CLP; 1659820 DepMap; ACH-000195 Lonza; 1318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473274
BioSample; SAMN10988088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1659820
PharmacoDB; Set2_1364_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM887564 GEO; GSM888647 GEO; GSM1374868 GEO; GSM1446764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1012054
Cosmic; 1519162 Cosmic; 1633513 Cosmic; 1943610 Cosmic; 2306995 IARC_TP53; 28307 LiGeA; CCLE_845 Progenetix; CVCL_2187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 16-Dec-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |