Cell line name | HCC3153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC 3153; HCC-3153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC3153 (RRID:CVCL_3377) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Triple negative breast cancer (TNBC) cell line. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Doubling time: 72.26 hours (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2347014). Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Gene fusion; WWC1-ADRBK2; in frame (PubMed=22032724).BRCA1 p.Thr276Alafs (c.815_824dupAGCCATGTGG) (PubMed=22032724). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Disease | Ductal breast carcinoma (NCIt: C4017) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=17157791; DOI=10.1016/j.ccr.2006.10.008 PubMed=19582160; DOI=10.1371/journal.pone.0006146 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279 PubMed=21778573; DOI=10.3233/BD-2010-0307 PubMed=22032724; DOI=10.1186/1755-8794-4-75 PubMed=24094812; DOI=10.1016/j.ccr.2013.08.020 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | DepMap; ACH-002324
LINCS_HMS; 51094 LINCS_LDP; LCL-2075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | EFO; EFO_0001179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC3153_498_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-TABM-157
GEO; GSM350507 GEO; GSM1053691 GEO; GSM1172966 GEO; GSM1172874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54881686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1136375
Cosmic; 1176634 Progenetix; CVCL_3377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 23 |