Cell line name | SUM159PT | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SUM-159-PT; SUM-159PT; SUM 159PT; SUM-159; SUM 159; SUM159; 159 PT; 159PT | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_5590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SUM159PT (RRID:CVCL_5423) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Triple negative breast cancer (TNBC) cell line. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Doubling time: 21.73 hours (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2347014). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=15677628). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis. Misspelling: SUM152; Occasionally. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for HRAS p.Gly12Asp (c.35G>A) (ClinVar=VCV000012612) (PubMed=19593635; PubMed=28889351).Heterozygous for PIK3CA p.His1047Leu (c.3140A>T) (ClinVar=VCV000013653) (PubMed=19593635; PubMed=28889351).TP53 p.Val157_Arg158insLeu (c.472_473ins3) (PubMed=16541312; PubMed=28889351). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Disease | Pleomorphic breast carcinoma (NCIt: C5161) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 71Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap; PubMed=25877200; PubMed=28889351 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://sumlineknowledgebase.com/?page_id=256 http://www.pawefish.path.cam.ac.uk/BreastCellLineDescriptions/SUM-159.html https://bioivt.com/sum-breast-cancer-cell-lines/ https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10424408; DOI=10.1023/A:1006135331912 PubMed=10604729; DOI=10.1038/sj.bjc.6695007 PubMed=11044355; DOI=10.1054/bjoc.2000.1458 PubMed=12800145; DOI=10.1002/gcc.10218 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=16397213; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-05-2853 PubMed=16541312; DOI=10.1007/s10549-006-9186-z PubMed=17157791; DOI=10.1016/j.ccr.2006.10.008 CLPUB00423 PubMed=19593635; DOI=10.1007/s10549-009-0460-8 PubMed=21778573; DOI=10.3233/BD-2010-0307 PubMed=23151021; DOI=10.1186/1471-2164-13-619 PubMed=23401782; DOI=10.1155/2013/872743 PubMed=23601657; DOI=10.1186/bcr3415 PubMed=24162158; DOI=10.1007/s10549-013-2743-3 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=28889351; DOI=10.1007/s10549-017-4496-x | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM01452
DepMap; ACH-001391 LINCS_HMS; 51083 LINCS_LDP; LCL-2068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | BTO; BTO:0004928
EFO; EFO_0001241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SUM159PT_1510_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-TABM-157 GEO; GSM75170 GEO; GSM217601 GEO; GSM412074 GEO; GSM412089 GEO; GSM412092 GEO; GSM412105 GEO; GSM412114 GEO; GSM412117 GEO; GSM421890 GEO; GSM474278 GEO; GSM474279 GEO; GSM476481 GEO; GSM476482 GEO; GSM476483 GEO; GSM478318 GEO; GSM478319 GEO; GSM478323 GEO; GSM478324 GEO; GSM847434 GEO; GSM847501 GEO; GSM844707 GEO; GSM844706 GEO; GSM967817 GEO; GSM967822 GEO; GSM1008917 GEO; GSM1053735 GEO; GSM1172993 GEO; GSM1214567 GEO; GSM1401652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54970841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 904389
Cosmic; 1046944 Cosmic; 1136380 Cosmic; 1287924 Cosmic; 1289412 Cosmic; 1460240 IARC_TP53; 24342 Progenetix; CVCL_5423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 12-Jan-2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |