Cell line name | HCC1588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-1588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_A351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC1588 (RRID:CVCL_A351) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) project. Population: African American. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: Transcriptome analysis. Omics: SNP array analysis. Derived from sampling site: Lung. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Heterozygous for KRAS p.Gly12Asp (c.35G>A) (ClinVar=VCV000012582) (CCLE).TP53 c.886_910del25 (PubMed=10353731). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Lung squamous cell carcinoma (NCIt: C3493) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 63Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10353731 PubMed=24002593; DOI=10.1038/bjc.2013.452 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | KCLB; 71588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCLE; HCC1588_LUNG
DepMap; ACH-001078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473071
BioSample; SAMN10987742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC1588_451_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM1374503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54881590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 903638
IARC_TP53; 11451 LiGeA; CCLE_148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 17 |