Cell line name | HCC60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | HCC0060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_G002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC60 (RRID:CVCL_G002) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a NCI-H23 derivative (PubMed=25877200). Originally thought to originate from a 26 year old female patient with an ovarian cystadenocarcinoma. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00533. Population: African American. Omics: Deep RNAseq analysis. Omics: SNP array analysis. Derived from sampling site: Lung. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | Homozygous for ATM p.Gln1919Pro (c.5756A>C) (ClinVar=VCV000580726) (from parent cell line).Heterozygous for KRAS p.Gly12Cys (c.34G>T) (ClinVar=VCV000012578) (from parent cell line).Homozygous for STK11 p.Trp332Ter (c.996G>A) (ClinVar=VCV000376339) (from parent cell line).Homozygous for TP53 p.Met246Ile (c.738G>C) (from parent cell line). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human)
(NCBI Taxonomy: 9606)
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_1547 (NCI-H23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 51Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v10_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=12429618 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontologies | EFO; EFO_0006418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC60_507_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | Wikidata; Q54881769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1113279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 11-Feb-2013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 29-Oct-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 18 |