Variant position:  89

Type of variant:  LB/B

Residue change:  From Glutamate (E) to Glutamine (Q) at position 89 (E89Q, p.Glu89Gln).

Physico-chemical properties:  Change from medium size and acidic (E) to medium size and polar (Q)

BLOSUM score:  2

Polymorphism:  At least three different alleles exist. The allele defined by Arg-6 and Glu-89 is associated with a risk of gastric cancer.

Other resources:  

• Variant rs17328091 [ dbSNP | Ensembl ]

Interleukin-2-induced, melanoma-specific T cells recognize CAMEL, an unexpected translation product of LAGE-1.
Aarnoudse C.A.; Van den Doel P.B.; Heemskerk B.; Schrier P.I.;
Int. J. Cancer 82:442-448(1999)
Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS LAGE-1A AND LAGE-1B); VARIANTS GLN-6 AND GLN-89;

Multiple pathogenic and benign genomic rearrangements occur at a 35 kb duplication involving the NEMO and LAGE2 genes.
Aradhya S.; Bardaro T.; Galgoczy P.; Yamagata T.; Esposito T.; Patlan H.; Ciccodicola A.; Kenwrick S.; Platzer M.; D'Urso M.; Nelson D.L.;
Hum. Mol. Genet. 10:2557-2567(2001)
Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]; VARIANTS GLN-6 AND GLN-89;

The DNA sequence of the human X chromosome.
Ross M.T.; Grafham D.V.; Coffey A.J.; Scherer S.; McLay K.; Muzny D.; Platzer M.; Howell G.R.; Burrows C.; Bird C.P.; Frankish A.; Lovell F.L.; Howe K.L.; Ashurst J.L.; Fulton R.S.; Sudbrak R.; Wen G.; Jones M.C.; Hurles M.E.; Andrews T.D.; Scott C.E.; Searle S.; Ramser J.; Whittaker A.; Deadman R.; Carter N.P.; Hunt S.E.; Chen R.; Cree A.; Gunaratne P.; Havlak P.; Hodgson A.; Metzker M.L.; Richards S.; Scott G.; Steffen D.; Sodergren E.; Wheeler D.A.; Worley K.C.; Ainscough R.; Ambrose K.D.; Ansari-Lari M.A.; Aradhya S.; Ashwell R.I.; Babbage A.K.; Bagguley C.L.; Ballabio A.; Banerjee R.; Barker G.E.; Barlow K.F.; Barrett I.P.; Bates K.N.; Beare D.M.; Beasley H.; Beasley O.; Beck A.; Bethel G.; Blechschmidt K.; Brady N.; Bray-Allen S.; Bridgeman A.M.; Brown A.J.; Brown M.J.; Bonnin D.; Bruford E.A.; Buhay C.; Burch P.; Burford D.; Burgess J.; Burrill W.; Burton J.; Bye J.M.; Carder C.; Carrel L.; Chako J.; Chapman J.C.; Chavez D.; Chen E.; Chen G.; Chen Y.; Chen Z.; Chinault C.; Ciccodicola A.; Clark S.Y.; Clarke G.; Clee C.M.; Clegg S.; Clerc-Blankenburg K.; Clifford K.; Cobley V.; Cole C.G.; Conquer J.S.; Corby N.; Connor R.E.; David R.; Davies J.; Davis C.; Davis J.; Delgado O.; Deshazo D.; Dhami P.; Ding Y.; Dinh H.; Dodsworth S.; Draper H.; Dugan-Rocha S.; Dunham A.; Dunn M.; Durbin K.J.; Dutta I.; Eades T.; Ellwood M.; Emery-Cohen A.; Errington H.; Evans K.L.; Faulkner L.; Francis F.; Frankland J.; Fraser A.E.; Galgoczy P.; Gilbert J.; Gill R.; Gloeckner G.; Gregory S.G.; Gribble S.; Griffiths C.; Grocock R.; Gu Y.; Gwilliam R.; Hamilton C.; Hart E.A.; Hawes A.; Heath P.D.; Heitmann K.; Hennig S.; Hernandez J.; Hinzmann B.; Ho S.; Hoffs M.; Howden P.J.; Huckle E.J.; Hume J.; Hunt P.J.; Hunt A.R.; Isherwood J.; Jacob L.; Johnson D.; Jones S.; de Jong P.J.; Joseph S.S.; Keenan S.; Kelly S.; Kershaw J.K.; Khan Z.; Kioschis P.; Klages S.; Knights A.J.; Kosiura A.; Kovar-Smith C.; Laird G.K.; Langford C.; Lawlor S.; Leversha M.; Lewis L.; Liu W.; Lloyd C.; Lloyd D.M.; Loulseged H.; Loveland J.E.; Lovell J.D.; Lozado R.; Lu J.; Lyne R.; Ma J.; Maheshwari M.; Matthews L.H.; McDowall J.; McLaren S.; McMurray A.; Meidl P.; Meitinger T.; Milne S.; Miner G.; Mistry S.L.; Morgan M.; Morris S.; Mueller I.; Mullikin J.C.; Nguyen N.; Nordsiek G.; Nyakatura G.; O'dell C.N.; Okwuonu G.; Palmer S.; Pandian R.; Parker D.; Parrish J.; Pasternak S.; Patel D.; Pearce A.V.; Pearson D.M.; Pelan S.E.; Perez L.; Porter K.M.; Ramsey Y.; Reichwald K.; Rhodes S.; Ridler K.A.; Schlessinger D.; Schueler M.G.; Sehra H.K.; Shaw-Smith C.; Shen H.; Sheridan E.M.; Shownkeen R.; Skuce C.D.; Smith M.L.; Sotheran E.C.; Steingruber H.E.; Steward C.A.; Storey R.; Swann R.M.; Swarbreck D.; Tabor P.E.; Taudien S.; Taylor T.; Teague B.; Thomas K.; Thorpe A.; Timms K.; Tracey A.; Trevanion S.; Tromans A.C.; d'Urso M.; Verduzco D.; Villasana D.; Waldron L.; Wall M.; Wang Q.; Warren J.; Warry G.L.; Wei X.; West A.; Whitehead S.L.; Whiteley M.N.; Wilkinson J.E.; Willey D.L.; Williams G.; Williams L.; Williamson A.; Williamson H.; Wilming L.; Woodmansey R.L.; Wray P.W.; Yen J.; Zhang J.; Zhou J.; Zoghbi H.; Zorilla S.; Buck D.; Reinhardt R.; Poustka A.; Rosenthal A.; Lehrach H.; Meindl A.; Minx P.J.; Hillier L.W.; Willard H.F.; Wilson R.K.; Waterston R.H.; Rice C.M.; Vaudin M.; Coulson A.; Nelson D.L.; Weinstock G.; Sulston J.E.; Durbin R.M.; Hubbard T.; Gibbs R.A.; Beck S.; Rogers J.; Bentley D.R.;
Nature 434:325-337(2005)
Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]; VARIANTS GLN-6 AND GLN-89;